Incubatoarele, autoclavele și bioreactoarele sunt trei piese de echipament folosite de microbiologi. Fiecare mașină are o funcție specializată în studiul bacteriilor, a virușilor și a altor microorganisme.
Incubatoarele păstrează condiții optime de mediu, facilitând microbiologii să crească bacteriile. Folosind un incubator, un microbiolog este capabil să controleze umiditatea, temperatura și nivelurile de oxigen. Un mediu de creștere este plasat în interiorul incubatorului pentru a se asigura că microorganismul are substanțele nutritive necesare pentru a prolifera.
Microbiologii trebuie să prevină contaminarea încrucișată a probelor lor. Pentru a face acest lucru, ei sterilizează instrumentele și consumabilele după ce le folosesc. Autoclavul expune echipamentele la abur saturat la presiune ridicată, ucigând bacterii și alte microorganisme. Autoclavele sunt adesea folosite pentru a steriliza echipamentele din sticlă și metal, dar ele nu pot fi folosite pentru a steriliza plasticul deoarece plasticul se topește la temperaturi atât de ridicate.
Bioreactoarele facilitează creșterea organismelor utilizate în aplicațiile biotehnologice. Această piesă de echipament este adesea folosită pentru a crește organismele utilizate în producția de vaccinuri și medicamente. Ca un incubator, un bioreactor permite microbiologului să controleze condițiile de creștere. Panoul de comandă al unui bioreactor are setări pentru nivelul pH-ului, nivelul oxigenului, viteza de amestecare, timpul de inducție și livrarea de nutrienți. O cameră de fermentare este un exemplu de bioreactor. Acest tip de cameră permite microbiologilor să utilizeze fermentarea pe scară largă pentru a produce organismele utilizate în producția de hormoni și vaccinuri.