În biologia modernă, există trei abordări pentru clasificarea organismelor: sistematică, cladistică și taxonomie moleculară evolutivă. Toate se bazează pe relațiile dintre organisme, dar folosesc indicatori diferiți pentru a atribui gradul de relație.
Taxonomia modernă sau sistemul de clasificare a provenit din secolul al XVIII-lea, din lucrările unui botanist suedez Carolus Linnaeus. El a clasificat ființele vii pe baza asemănărilor dintre ele. Organismele care s-ar putea încrucișa au fost puse într-o singură specie. Există niveluri de organizare deasupra speciilor: genul, la care apar o serie de specii strâns legate, o familie, care constă din genuri conexe și ordine, care include familii similare. Clasa, tribul și regatul sunt cele trei niveluri superioare ulterioare ale sistemului. Aceste grupe mari pot include subgrupe, de exemplu subfile, sau pot face parte dintr-o supergrupă, de exemplu, o superclasă.Când Carolus Linnaeus își dezvolta sistemul, evoluția nu era încă un fapt științific. Odată ce oamenii de știință au început să studieze modul în care diferite organisme sunt legate unele de altele pe baza unui strămoș comun pe care îl împărtășesc, clasificarea a avansat, de asemenea. Sistemul de clasificare filogenetică, sau sistematică, enumeră clades de organisme, organizate în diagrame în unghi drept, care au un strămoș comun. În cladistică, separarea se face în momentul în care apare o trăsătură care face o anumită specie unică. Poate fi, de exemplu, mersul pe jos pentru oameni. Un sistem similar de taxonomie moleculară evoluționistă se concentrează asupra apariției diferențelor genetice între specii.
