Există multe diferențe între șobolani și șoareci, cum ar fi dimensiunea, comportamentul și forma botului lor. Șoarecii sunt de obicei între 4 și 8 centimetri lungime, inclusiv cozile lor, cu botul cu formă triunghiulară. Șobolanii au boturi goale și sunt mult mai mari, crescând la aproape 16 centimetri.
Diferența dintre șobolani și șoareci depășește caracteristicile fizice. Oamenii de stiinta au descoperit ca cei doi rozatoare au trasaturi comportamentale foarte diferite. Șobolanii tind să manifeste mai multă prudență, în timp ce șoarecii tind să fie curioși și investighează împrejurimile lor. Șobolanii au nevoie de timp să se obișnuiască cu împrejurimile lor. Acest lucru explică de ce mouse-ul este prins mult mai repede decât un șobolan când este setat o capcană.Șoarecii pot, de asemenea, să se reproducă mai des decât șobolanii. Un șoarece de sex feminin poate da naștere de 10 ori pe an, în timp ce un șobolan de sex feminin are doar șase perioade gestaționale. Cu toate acestea, șobolanii tind să trăiască mai mult, până la 1,5 ani, în timp ce speranța medie de viață a mouse-ului este de nouă până la 12 luni.
Șoarecii sunt foarte frică de șobolani și nu locuiesc în aceeași zonă din cauza fricii de a fi mâncați. Șobolanii dau un miros care nu numai că alertează mouse-ul că șobolanul este în apropiere, ci creează și un efect negativ asupra reproducerii și comportamentului mouse-ului.