Datele științifice sugerează că frecarea unei soluții de oțet pe piele nu este un tratament eficient împotriva fungilor. Institutul Național de Sănătate avertizează împotriva folosirii oțetului în scopuri medicale, deoarece iritarea pielii și afectarea foliculului pilos pot apărea. Dovezile științifice nu susțin în mare măsură utilizarea oțetului în medicina modernă.
Datele științifice susțin faptul că oțul este foarte ridicat în acid acetic, ceea ce îl face un agent antibacterian eficient în unele cazuri, potrivit Societății Americane de Microbiologie. Chiar și atunci când este utilizat ca dezinfectant de uz casnic, oțetul este puțin eficace împotriva multor tulpini de agenți infecțioși, cum ar fi E. Coli și Staphylococcus, potrivit Institutului Național de Sănătate.