În noiembrie 2015, Johnny Mathis nu a fost niciodată căsătorit. Mathis sa identificat din greșeală drept homosexual într-un interviu din 1982 pentru revista "Us", în care el a declarat critic că a devenit obișnuit cu stilul de viață homosexual .
Comentariile lui Mathis în interviul lui Us Magazine au fost controversate, iar Mathis a refuzat să-și clarifice declarațiile, ceea ce la lăsat pe mulți fani nesiguri de orientarea sa sexuală. Mathis și-a recunoscut oficial homosexualitatea într-un interviu în 2006, subliniind că reticența sa de a-și clarifica declarațiile provine din amenințările cu moartea pe care le-a primit ca răspuns la articol. Mathis a recunoscut, de asemenea, că reticența sa de a-și recunoaște orientarea sexuală se datorează parțial normelor sociale ale generației sale.