Tema sălbăticiei versus civilizație din "Lordul muștelor" surprinde impulsurile concurente din interiorul umanității: primul instinct este cel al civilizației, în care indivizii urmează reguli create pentru binele grupului și au moral valori, față de cel de-al doilea instinct față de violență, acțiuni rele, egoism și putere cu orice preț. Când privim dintr-o lentilă mai largă, acesta este conflictul înnăscut dintre bine și rău.
Golding asociat răul cu sălbăticie și bine cu civilizația. În romanul său, personajele sunt băieți bine instruiți din țara civilizată a Marii Britanii, care se pierd într-o junglă sălbatică. Încet, își pierd moralitatea și își dau seama de dorințele lor de putere, de control și de violență, pe care Golding le ilustrează figurat prin fiară.Golding credea că civilizația doar maschează fiara în interiorul oamenilor. Când Jack și tribul său devin sălbatici, încep să se închine acestei ființe pe care și i-au imaginat-o, chiar lăsându-i ofrandele. Caracterele lui Golding întruchipează aceste instincte concurente de civilizație și sălbăticie: Ralph reprezintă o conducere ordonată și civilizată, în timp ce Jack reprezintă anarhie, barbarism și sete pentru putere.
În centrul celor mai importante și dorințe înnăscute, Golding credea că oamenii sunt răi. Civilizația suprimă dorințele firii; sălbăticia le exploatează și le permite oamenilor să-și dea în dorințele lor violența și răul.
