Povestea din modul "Zombie Call of Duty Black Ops 2" se învârte în jurul lui Edward Richtofen după evenimentele din luna DLC din "Call of Duty Black Ops". Modul poveste, intitulat Tranzit, permite jucătorilor să încerce să rezolve misterul de ce Pământul este pe moarte în timp ce se luptă prin hoardele nesfârșite de zombi. Jucătorul primește asistență atât de la Richtofen cât și de la Dr. Maxis.
Potrivit site-ului oficial "Call of Duty", în timp ce modul zombie al "Call of Duty" are un arc de poveste, nu este o campanie datorită trăsăturii sale nesfârșite. Chiar și modul Tranzit în "Black Ops 2", în timp ce se concentrează asupra aspectelor legate de poveste, este în primul rând un joc bazat pe scoruri. "Black Ops 2" are patru moduri Zombie diferite. Tranzit este o hoardă nesfârșită de zombi, cu diverse aspecte legate de poveste și o lume deschisă. Modul de supraviețuire se desfășoară într-un anumit segment al lumii deschise Tranzit și alungă jucătorii împotriva unei hoarde nesfârșite. Modul Grief găsește echipe de patru jucători umani unul împotriva celuilalt, precum și împotriva zombiilor. Jucătorii pot alege să se lupte între ei sau să încerce să folosească zombi în avantajul lor. În cele din urmă, jocurile personalizate permit jucătorilor să ajusteze tipurile de articole, modalitățile de a ucide zombi și limita de timp a jocului lor.
