Corpurile de apă din Orientul Mijlociu includ râul Amu Darya, râul Eufrat, râul Indus, râul Tigris, Golful Persic și râul Nil. Cel mai mare lac din Orientul Mijlociu este Lacul Urmia din nord-vestul Iranului, care are o suprafață de 2.000 de kilometri pătrați și o adâncime maximă de 52 de metri.
Corpurile de apă care frontierează țările din Orientul Mijlociu includ Oceanul Indian, Marea Mediterană, Marea Roșie, Marea Neagră, Golful Aden, Marea Arabiei, Golful Persic și Marea Caspică.
Canalul Suez, un corp de apă creat de om în Egipt, care leagă Marea Mediterană și Marea Roșie, a deschis trecerea navelor comerciale în 1869. Are o lungime de 100,82 mile, cu două canale de acces de 14 mile și 5,6 mile .Râul Nile de 4258 de mile care curge prin Egipt este cel mai lung fluviu din lume. Gura sa este situată pe malul Egiptului cu Marea Mediterană.
Râul Eufrat curge prin Turcia, Siria și Irak, terminându-și drumul în Golful Persic. Orașul vechi Babilon se află pe malul râului.
Râurile Indus și Tigris se îmbină pentru a deveni râul Shatt al Arab, care, de asemenea, curge în Golful Persic. Râul Tigris are o lungime de 1.180 de mile.
