Cel mai faimos corp de apă din Boliva este Lacul ("Lago" în limba spaniolă) Titicaca, cel mai mare lac din America de Sud și cel mai mare lac navigabil comercial de pe Pământ. Alte lacuri din bazinul Altiplano includ Poopó, Salar de Coipasa, Salar de Uyuni și Uru Uru. Lacurile din bazinul Altiplano variază de la sălbatic la sărat. Lacurile dulci din zonele joase includ Huaytunas, Rogaguado, Rogagua, Guachuna și El Océano.
Cel mai notabil râu din Bolivia este Amazonul. Alte râuri mari din bazinul Amazonului includ Madiera, Beni, Madre de Dios, Mamore, Yata, Iténez (cunoscut și sub numele de Guaporé), Itonmas (cunoscut și ca San Miguel, San Julián sau San Pablo), Río Blanco sau Agua Caliente), San Martin, Río Grande (cunoscută și sub numele de Guapay) și Acre. Bazinul La Plata conține râurile Paraguay, Bermejo și Pilcomayo.
Sol de Mañana este o gheizer în departamentul Potosi din sud-vestul Boliviei. Strâmtoarea Tiquina este canalul care leagă cele două jumătăți ale lacului Titicaca, Lacul Chicuito și lacul Pequeno mai mic.
Bolivia este închisă la mare și nu se conectează cu marea în orice direcție, deși Lacul Titicaca este suficient de mare pentru a avea un efect atenuant asupra climatului înconjurător.
