Structura legată de membrană care conține enzime digestive este lizozomul. Lizozomii conțin enzime care descompun macromolecule organice cum ar fi carbohidrați, grăsimi și proteine. Toate celulele animale conțin lizozomi, dar ele sunt cele mai prezente în celulele sistemului imunitar, cum ar fi celulele albe din sânge.
Aproximativ 40 de enzime digestive diferite se află în interiorul unui lizozom. Aceste enzime sunt realizate prin organele numite ribozomi care sunt atașate la reticulul endoplasmatic și puse în pachete de către corpurile Golgi. Interiorul sau matricea unui lizozom are un pH acid de aproximativ 4,8, ceea ce reprezintă mediul optim pentru enzimele. În afara lizozomului, aceste enzime sunt transformate în inofensive deoarece pH-ul este neacid și nu susține funcționarea normală a enzimelor lizozomale.