În timp ce nu există nici o echipă definitivă "cea mai bună" în Pokémon, există liste de nivel care să clasifice cel mai bun Pokémon din fiecare generație pe baza statisticilor, eficacității în luptă și al clasamentului împotriva altor Pokémon. Datorită mișcărilor noi, noului Pokémon și a noului tip de meci de la fiecare generație, aceste niveluri se schimbă în fiecare joc. Pentru Pokemon Emerald, cei mai buni Pokemon sunt cei din clasa a treia generație uber.
Există nouă niveluri oficiale în Pokémon: nu au evoluat pe deplin, cupă mică, niciodată folosită, limită 3, rar utilizată, limită 2, subutilizată, limită, suprautilizată și uber. Nivelul Uber conține cel mai puternic Pokémon. Cea de-a treia generație de uber se compune în întregime din Legendarul Pokémon, cu excepția lui Wobbuffet și Wynaut. Acestea includ Mewtwo, Mew, Lugia, Ho-oh, Latias, Latios, Kyogre, Groudon, Rayquaza și toate formele de Deoxys. Cu toate acestea, este de remarcat faptul că acest lucru include doar șase din cele 17 tipuri disponibile în Pokémon a treia generație. Prin urmare, o echipă care include doar aceste Pokémon poate să nu se potrivească bine cu alte echipe numai datorită dezavantajelor de tip. Poate merita folosirea lui Pokémon de la nivelul mai diversificat. Acestea includ Pokémon cum ar fi Gengar, Rhydon, Umbreon și Raiku. De asemenea, este important să se țină seama de formarea și abilitățile EV. Cu o pregătire adecvată, chiar și un Pokémon de la unul dintre nivelurile inferioare poate să se ridice la un nivel uber sau suprautilizat.
