Desertul siberian se afla in regiunea Trans-Baikal din Rusia, la aproximativ 300 de mile est de Lacul Baikal. Desertul se afla in tundra Rusiei, o regiune rece, uscata, creştere. Acesta este situat între lanțurile muntoase Kodar și Udokan, aproape de granița cu China.
Societatea geografică a Rusiei observă că deșertul este de aproximativ 7 mile lungime, la 3 mile lățime. Cel mai apropiat centru al populației este capitala districtului Chara, care este la aproximativ patru mile de la deșert. Excursii turistice în deșert, în general, începe în Chara. Deși nu există drumuri asfaltate, deșertul siberian poate fi accesat pe jos, pe călărie sau pe vehicule off-road.
