Patagonia se află la capătul sudic al Americii de Sud într-o zonă alcătuită din terenuri împărtășite de Chile și Argentina. Este o regiune foarte diversă din punct de vedere geografic, incluzând două coaste oceanice, munții Anzi, deșerturi, stepi și pășuni.
Marginea de nord a Patagoniei este marcată de râurile Colorado și Barrancas, ambele care circulă din munții Andei de-a lungul coastei Pacificului până la Oceanul Atlantic în est. Patagonia se întinde spre sud până la Strâmtoarea Magellanului, care marchează vârful sudic al continentului sud-american. Suprafața totală a Patagoniei este puțin peste 1 milion de kilometri pătrați.