În Pokemon Emerald, luați-o pe Cyndaquil vorbind cu profesorul Birch după ce ați terminat intrarea lui Hoenn Pok? dex. El oferă unul dintre cei trei începători Pokemon de la Generația II: Chikorita, Cyndaquil sau Totodile. Aceasta este doar o caracteristică în Pokemon Emerald; jucătorii nu primesc aceeași recompensă pentru finalizarea Pokédex-ului în Pokemon Ruby și Sapphire.
Hoenn Pok? dex conține 202 Pokemon, 135 din care au fost introduse în Generația III. Pentru a-l completa, jucătorii trebuie să dețină fiecare joc pe care îl joacă, inclusiv cele trei starter Pokemon: Treecko, Torchic și Mudkip. Deoarece jucătorii pot alege doar unul dintre aceștia la începutul jocului, finalizarea jocului PokeDex necesită tranzacționarea de la alte copii ale Pokemon Ruby, Sapphire sau Emerald.
În plus, există cinci Pokémon în Hoenn Pok? dex care nu apar în Pokemon Emerald, care trebuie să fie comercializate de la versiunile Ruby și Sapphire: Meditite, Medicham, Roselia, Zangoose și Lunatone. /p>Există, de asemenea, legendarul Pokemon Jirachi și Deoxys, care nu apar în niciun joc din Generația III fără conexiuni la alte jocuri sau prin articole primite la evenimente speciale din lumea reală. Jirachi este disponibil numai pe discul bonus Bonus Colosseum, prin completarea jocului Pokemon Channel sau prin ofertele speciale. Deoxys se găsește numai în joc pe Insula Nașterii, care necesită un bilet Aurora de la un eveniment Nintendo pentru a accesa.