John Denver sa întâlnit cu Annie Martell la un colegiu din Minnesota, unde a jucat cu formația sa. Cei doi s-au căsătorit în anul următor și au adoptat mai târziu doi copii, Zachary și Anna Kate. Denver și Martell s-au divorțat în 1982.
Denver sa căsătorit cu cea de-a doua soție, actrița Cassandra Delaney, după o curte de doi ani. Denver și Delaney aveau o fiică, Jesse Bell. Cuplul sa despărțit în 1991 și sa divorțat în 1993.