Rugul în apa din puț poate proveni din depozitele de fier sau mangan care se amestecă cu aerul, cunoscut și sub numele de bacterii de fier. Bacteriile pot să crească într-un material subțire care se lipeste de conductele de puțuri. Acest lucru poate determina schimbarea culorii apei, un gust sau miros ciudat.
Deși nu se știe dacă bacteriile de fier pot cauza o boală, pot crea un mediu bun pentru creșterea altor bacterii dăunătoare. Atunci când se repară pompele, țevile pentru puțuri și echipamentele pentru puțuri, acestea trebuie dezinfectate corespunzător. Un laborator poate testa apa dacă există vreo indicație că apa din sondă este contaminată.