În timp ce un cuptor cu auto-curățare poate economisi mult timp și hassle în bucătărie, cuptoarele extrem de murdare necesită o pre-curățare în prealabil. Rularea ciclului de auto-curățare cu o cantitate mare de murdărie poate necesita mai multe cicluri și poate chiar să deterioreze suprafețele din interiorul cuptorului.
Ciclul de auto-curățare folosește căldura excesivă pentru a incine reziduurile alimentare. Unele tipuri de deversări devin problematice la temperaturi ridicate. Restul de zahăr poate să se izbucnească în flăcări, marindu-se în interiorul suprafeței cuptorului. Puternic cocoșul poate să blocheze fluxul de aer, cauzând supraîncălzirea elementelor și eventual declanșarea unei defecțiuni electrice. Cu cât mai mult material trebuie eliminat, cu atât mai mult timp cuptorul trebuie să lucreze pentru ao arde.