Hexagonii apar în natură în multe locuri, cum ar fi celulele interconectate ale unui stup și cristalele unei fulgii de zăpadă. Cojile de țestoase sunt adesea acoperite cu marcaje hexagonale. Giuseppe's Causeway în Scoția este o caracteristică geografică compusă din 40.000 de coloane hexagonale de bazalt. Hexagoanele sunt utilizate în mod obișnuit pentru țigle, pietre de pavaj și alte acoperiri de pereți și podea, în timp ce panourile solare sunt adesea alcătuite din rețele hexagonale.
Apariția naturală a hexagonilor se datorează modului eficient în care forma hexagonală face uz de spațiu. Hexagonul este unul dintre doar trei poligoane regulate care se potrivesc împreună pentru a acoperi o suprafață plană fără lacune, celelalte două fiind pătratul și triunghiul echilateral.
Deoarece un hexagon are mai multe laturi decât un pătrat sau un triunghi, zona are un perimetru fix mai compact decât oricare dintre ele. Aceasta înseamnă că celulele hexagonale ale fagurelor utilizează cea mai mică cantitate de ceară necesară pentru a închide spațiul maxim, fără a pierde spațiu între celule.
Aranjamentul hexagonal permite, de asemenea, împachetarea densă a obiectelor circulare. De exemplu, marmură așezată într-un vas rotund se aranjează în mod natural într-o formă hexagonală, cu șase marmură grupate în jurul unei marmuri centrale.
