Calciul apare ca stalactiți și stalagmiți în caverne și se găsește și în depozitele de minerale din izvoarele termale. Acesta constituie cochilii de organisme marine, cum ar fi bivalve și echinoderme.
Calcitele se găsesc în rocile sedimentare, în principal calcar, care este alcătuit din cochilii de organisme marine moarte.
În peșterile de calcar, apa de ploaie curge peste pietre și preia dioxidul de carbon și alte minerale din calcar. Această combinație creează bicarbonat de calciu, care este în esență o soluție dizolvată de calcit, în apă. Apa se scurge din tavan și lasă în urma calcitului care devine un stalactit în timp. O formă de stalagmită se formează atunci când stalactitul picură apă pe podeaua peșterii, iar apa se depune de calcite într-o grămadă în creștere în timp.
Calciul este prezent în cochilii de scoici, corali, crabi și alte organisme marine. Este de asemenea prezentă în părțile dure ale algelor roșii, niște viermi de tuburi și niște bureți. Se găsește în roci vulcanice sau roci de manta, cum ar fi kimberlit, carbonatiți și peridotiți.
Peștera din râul Snowy din New Mexico conține un strat de albastru al calcitului, care este atribuit microorganismelor și a apelor subterane care dizolvă pereții peșterii de-a lungul timpului.
Cele mai mari cristale de calcite înregistrate vreodată au fost descoperite în Islanda și au cântărit aproximativ 250 de tone.