În afară de cea mai cunoscută caracteristică, care este canalul artificial care îl bisectează, Republica Panama conține munți accidentați, câmpii de coastă și dealuri. cuprinde națiunea de 29.157 de mile patrate este un izmut care leagă continentele Americii de Nord și Americii de Sud. Canalul Panama, care a fost finalizat în 1914, permite navelor să traverseze oceanele Oceanului Atlantic și Pacific care se află la nord și la sud de Istmul Panama.
Panama este cea mai sudică țară din America Centrală și este mărginită de Columbia în partea sud-americană și de Costa Rica în partea central-americană. Coloana vertebrală centrală a munților și a dealurilor este principala caracteristică topografică a națiunii. Vârfurile coloanei vertebrale au fost formate de intruziuni vulcanice, iar regiunea muntoasă a fost rezultatul unei înălțimi originare din fundul mării. Întreaga zonă montană, care se deplasează din Costa Rica în nord-vest și până la canal, este în general menționată drept Cordillera Central. Cel mai înalt punct din Panama este vârful muntelui Volcan Baru la 11.401 de metri.
Există o junglă aproape impenetrabilă, numită Darien Gap, în punctul în care Panama se învecinează cu Columbia. Această zonă este singura pauză din întregul sistem pan-american de autostrăzi care leagă Alaska de regiunea Patagonia din sudul Argentinei.