Unele dintre principalele corpuri de apă din Alabama sunt râul Alabama, râul Tennessee, râul Tombigbee, raul Black Warrior, râul Mobile, râul Cahaba, râul Coosa, râul Tallapoosa, râul Chattahoochee, râul Choctawhatchee, râul Conecuh , Golful Mobile Bay și Choctawhatchee. Nu există lacuri naturale în Alabama; totuși, unele lacuri artificiale au fost create din barajele și rezervoarele construite pe diferitele lor râuri.
Majoritatea sistemelor de apă din Alabama golesc în Golful Mexic. Râul Mobile se formează la confluența râului Alabama și a râului Tombigbee. Alte lacuri artificiale din Alabama sunt Guntersville, West Point, Aliceville, Bear Creek, Bankhead și Harding.
