Numeroase specii de ciuperci pot afecta copacii veșnic verzi, majoritatea necesitând propriile metode unice de tratament și control. Unele dintre cele mai frecvente probleme și boli cauzate de ciupercile veșnic verzi includ putregai, cankers, boala aruncată cu ac și rugină.
Cancerii fungice sunt unul dintre tipurile mai răspândite de boli evergreen, care sunt cauzate de o infecție internă a uneia dintre mai multe specii de ciuperci diferite. Aceste cancuri sunt zone de scoarță moartă, care sunt de obicei vizibile datorită rășinii albe lipicioase care scurg din ele. Ciuperca provoacă moartea scoarței, ceea ce duce la distrugerea zonei înconjurătoare și la pierderea acelor, cunoscută sub denumirea de boala aruncată cu ace. Această boală afectează numai copaci care sunt stresați de alți factori de mediu și pot fi, de obicei, tratați prin aerarea și fertilizarea zonei din jurul copacului.
Dacă arborele are un tip de ciupercă de rugină sau de stomac, singura metodă eficientă de tratare este să se pulverizeze cu un fungicid aprobat. Dacă arborele suferă de o ciupercă de rădăcină, probabil este legată de drenarea necorespunzătoare a solului. Fungicidul poate ajuta într-un astfel de caz, dar mai întâi este necesar să se rezolve problema excesului de apă pentru a preveni returnarea infecției.