Forme de relief majore din Mississippi includ Câmpia Mississippi; Câmpia de coastă; zonele umede de coastă; Râurile Mississippi, Pearl, Big Black și Yazoo; Rezervorul Ross Barnett; Mississippi Sound; și lacurile Enid, Grenada și Sardis. Alte forme de relief semnificative includ râul Pascagoula, râul Tombigbee, Lacul Arkabutla, Munții Cumberland, Golful St. Louis, Golful Biloxi, Golful Pascagoula și Delta Mississippi.
Cea mai înaltă altitudine din Mississippi se află la poalele munților Cumberland, la Muntele Woodall, care măsoară 807 de metri deasupra nivelului mării, în timp ce cea mai mică altitudine se află la nivelul mării de-a lungul coastei Golfului. Câmpia de coastă a Golfului de Est acoperă cea mai mare parte a statului, inclusiv dealurile joase ale Pine Hills și dealurile din nordul Central. Lacul Sardis este cel mai mare lac din Mississippi, cu o suprafață de 98.520 de acri și un volum de 1.51 milioane de metri pătrați. Este alimentat de râul Little Tallahatchie. Delta Mississippi este zona delimitată de râul Mississippi și de râul Yazoo și face parte din câmpia aluvionară din Mississippi. Cel mai lung râu din stat este Pearl River, care intră în Golful Mexic după o călătorie de 450 de mile. Mississippi Sound acasă la o serie de insule mici care fac parte din insulele Golfului Insulelor Golfului, inclusiv insulele Petit Bois, Cat, Ship and Horn.
