Cel mai important avantaj al software-ului personalizat este că acesta este adaptat nevoilor specifice ale utilizatorilor. O afacere nu trebuie să-și adapteze procesele pentru a profita pe deplin de software. Software-ul personalizat este mai scalabil decât pachetele de software deja pregătite. Economisește, de asemenea, bani pe costul achiziției hardware.
Software-ul personalizat este special conceput pentru a satisface nevoile unei afaceri date. Acest tip de software poate ajuta la protejarea unei afaceri de amenințările externe. Software-ul folosit în mod obișnuit este vulnerabil la hacking. Software-ul personalizat, pe de altă parte, poate fi o țintă improbabilă pentru hackeri, deoarece poate necesita mult mai multe eforturi pentru a înțelege cum poate fi încălcat sistemul. Software-ul personalizat este mult mai probabil să fie compatibil cu sistemele existente. Este mai puțin probabil ca mai multe pachete de software gata de utilizare să se potrivească perfect și fără pierderi. Utilizatorii pot menține aplicații personalizate atâta timp cât trebuie să fie utilizate. Cu pachetele software gata făcute, pe de altă parte, o afacere se află la mila dezvoltatorilor sau furnizorilor de software. În cazul în care dezvoltatorii de software ies din afaceri sau decid să nu întrețină produsul, atunci utilizatorul este obligat să treacă la software.
