Este posibil să plasezi melodii pe un iPod fără iTunes utilizând alte programe care permit transferul de muzică de la un calculator la dispozitiv. Există alternative pentru iTunes disponibile pentru Windows, Linux, și sistemele OSX.
Există opțiuni software pentru terți pentru proprietarii de iPod care doresc să transfere muzică pe dispozitivul lor fără a utiliza iTunes. Aceste opțiuni necesită utilizatorii să descarce software-ul pe computerul lor. Conectați iPod-ul și activați software-ul instalat. Opțiunile gratuite, cum ar fi SharePod sau PodTrans, permit utilizatorului să vadă copierea sau mutarea fișierelor muzicale de la un computer Windows la iPod. Podworks și PodUtil servesc aceluiași scop pentru OSX și respectiv Linux. Fiecare program are o interfață prin care utilizatorii selectează locația muzicii pe computer, indiferent dacă doresc să o copieze sau să o transfere și unde doresc să o salveze pe iPod.