Unele dintre diferențele dintre "doamna Pacman" și "Pacman" includ adăugarea unei perechi suplimentare de tuneluri de urzeală în trei din cele patru labirinturi de joc. De asemenea, labirintele în sine sunt diferite de jocurile originale "Pacman".
În jocurile "Ms. Pacman", modelele de comportament ale fantomelor sunt diferite de cele din "Pacman", și includ, de asemenea, un element aleatoriu în mișcările fantomelor. Acest lucru împiedică jucătorii să memoreze modelele în care se mișcă fantomele, făcând jocul un pic mai dificil decât "Pacman".
Fructele din joc se comportă diferit. În loc să se reproducă în centrul hărții, fructele din "doamna Pacman" se aruncă de-a lungul labirintului în mod aleatoriu, intră și ies din tunelurile de urzeală din fiecare labirint. În plus, odată ce au fost întâlnite toate fructele, acestea se produc în mod aleatoriu. Aceasta începe în a 8-a rundă.
S-au făcut și schimbări în animația morții d-na Pacman. În loc să se plieze pe sine și să dispară ca Pacman, doamna Pacman se rotește pur și simplu de fiecare dată când atinge o fantomă. Efectele sonore ale muribundului ei se schimbă, la fel ca multe alte sunete din joc.
"Doamna Pacman" are un bug în subrutinele sale, care determină ca jocul să devină unplayabil după runda a 256-a. Cu toate acestea, numeroase alte bug-uri apar mult mai devreme în timpul gameplay-ului, ceea ce face puțin probabil ca un jucător să ajungă în runda 256 fără a utiliza emularea.