Există mai multe tipuri de forme naturale de apă în și în jurul Filipinelor, inclusiv canale, mlaștini, strâmtori, golfuri, mări, golfuri, cascade, râuri și lacuri. Fiind un arhipelag, linia de coastă ar măsura aproximativ 10.847 mile dacă este așezată la capăt.
Filipine este mărginită de Canalul Babuyan la nord, Marea Chinei de Sud la vest și Marea Celebes la sud. Coasta sa de est se confruntă cu Oceanul Pacific.Mai multe râuri și lacuri interioare din insule au fost formate și prin diverse activități geologice.
- Râuri: Cel mai lung și cel mai mare râu din Filipine este râul Cagayan din nordul Luzonului. În dimensiune sunt Rio Grande de Mindanao și, respectiv, râul Agusan, ambele găsite în Mindanao. Alte râuri deosebit de mari includ râurile Bicol, Angat Pampanga, Pasig și Agno din Luzon. Cel mai faimos râu printre turisti este râul subteran Palawan.
- Lacurile: Laguna de Bay, în formă de inimă, este cea mai populară; este de asemenea cel mai mare lac din Filipine și al doilea cel mai mare lac de apă dulce din Asia de Sud-Est. Alte lacuri populare includ lacurile Taal, Buhi, Bulusan, Naujan, Mainit și Lanao.
- Cascade: Cascadele din Filipine joacă un rol foarte important în economia țării generând putere; acestea servesc și ca situri de atracție turistică. Cea mai mare cascadă este cascada Limunsudan pe două nivele găsită în Barangay Bonbonon. Este urmat îndeaproape de Maria Cristina Falls. Cea mai renumită cascadă din Filipine este Pagsanjan Falls situată în Laguna.
