Cel mai frecvent portal de intrare pentru agenții patogeni este tractul respirator. Agenții patogeni intră prin particule de praf sau picături care intră în tractul respirator. Unii agenți patogeni care intră în acest mod sunt virusii cunoscuți sub numele de gripă, pojar și varicelă-zoster, care provoacă varicela.
Adulții obișnuiți pot respira în aproximativ 21 de picioare cubi de aer în fiecare zi, oferind numeroase oportunități de infecție. Virușii infectează tractul respirator prin atașarea la celule și înmulțirea. Unele dintre cele mai frecvente infecții ale acestei zone sunt răceala comună, bronșiolita și pneumonia.
Alte portaluri includ pielea, tractul gastro-intestinal și tractul genito-urinar. Exemple de infecții includ oreionul, tetanosul, malaria și SIDA.