Geografia coloniei New Hampshire a fost o varietate de dealuri, munți, coastă joasă și platouri. Munții erau plini de copaci, iar solurile din alte zone erau atât de stâncoase și sărace, încât făceau zona dificil de fermă. Râurile Merrimack și Piscataqua au format granițele coloniei.
Geografia și climatul colonialului New Hampshire au făcut dificilă agricultura. Era cea mai rece dintre colonii cu veri scurte, ușoare și ierni lungi. Chiar și așa, coloniștii au reușit să crească niște porumb, squash, fasole, secară și dovleci. Deoarece colonia a fost de coastă, coloniștii au făcut mult pescuit și au putut să vândă pește și lemn din pădurile lor către celelalte colonii pentru fructe și legume.