Deși FDA nu a eliminat niciun dezinfectant lichid care utilizează alcoolul ca agent principal pentru a fi utilizat în setările clinice, alcoolul izopropilic sa dovedit eficient în uciderea microorganismelor în anumite condiții, potrivit Centrului pentru Controlul și Prevenirea Bolilor. Printre diferitele tipuri de alcool disponibile pentru sterilizare, alcoolul isopropilic este în mod constant unul dintre cele mai bactericide.
După cum a relatat CDC, s-au efectuat studii clinice privind alcoolul metilic, alcoolul etilic și alcoolul izopropilic pentru a determina eficiența lor relativă în suprafețele de sterilizare. Toate formele de alcool au suferit o scădere semnificativă a eficacității atunci când au fost diluate la concentrații sub 50%. Niciunul nu sa dovedit capabil să ucidă sporii bacterieni sau să penetreze straturi de proteine groase. Dintre soiurile testate, totuși, alcoolul izopropilic a demonstrat capacitatea de a ucide virușii atât pentru hepatita B, cât și pentru herpes. A fost ușor mai eficace decât alcoolul etilic la dezinfectarea populațiilor de E. coli și S. aureus.
De asemenea, s-a constatat că alcoolul izopropilic a fost eficace în dezinfectarea capetelor de traductor reutilizabile. CDC avertizează totuși că germicidii pe bază de alcool nu sunt în general recomandați pentru sterilizarea instrumentelor chirurgicale. Acest lucru se datorează faptului că nici unul dintre agenții testați nu a reușit să distrugă în mod fiabil sporii diferitelor bacili, iar infecțiile fatale au fost uneori urmărite la utilizarea de unelte tratate cu alcool.